Одной из черт генетики кошек является наследование генов, сцепленных с половыми хромосомами. Из всего набора хромосом, соединенных в пары по размеру и форме, существует специальная пара, которая определяет пол. Они известны как пара хромосом X/Y. X - это большая хромосома, которая содержит в себе множество генов. В паре с X стоит Y, относительно небольшая хромосома, которая содержит немного генов. Главной функцией хромосомы Y является индуцирование развития эмбриона в особь мужского пола.
Правило парности хромосом у всех животных сохраняется и для хромосом X и Y. У самок две X хромосомы, а у самцов -X и Y. Половые клетки самок могут иметь только хромосому X, а половые клетки самцов - как X, так и Y. Случайное слияние половых клеток при зачатии приводит к образованию равного количества оплодотворенных яйцеклеток с набором XX и XY. Первые развиваются в самок, а вторые - в самцов, причем в соотношении 1:1. Проще сказать: самец определяет пол особи.
Мутировавшим геном, сцепленным с половой хромосомой, является ген О оранжевого окраса. Этот ген преобразует пигментные гранулы, окрашенные в черно-коричневый цвет, в желтый, их форма также изменяется из овальной в сферическую. Эти эффекты и приводят к появлению оранжевого окраса. Ген О наследуется как доминантный по отношению к нормальному гену, который обозначается как о. Этот ген называют сцепленным с половой хромосомой, потому что он находится в хромосоме X.
Коты с одной X хромосомой и генотипом о могут быть окрашены нормально (полосатые, черные и т. д.), или могут быть красными с генотипом О. С другой стороны, кошки (особи женского пола) с их двумя хромосомами X могут быть также окрашены нормально (генотип оо) или быть красными (генотип ОО). Однако они также могут иметь генотип Оо, и тогда будет черепаховый окрас, шерсть нормального окраса (черного или полосатого) с красными отметинами. Наследование гена О намного сложнее, чем обычное, потому что во внимание нужно принимать пол каждого родителя.